《动物管理局》大结局是郝运和吴爱爱最后联手侦破了明德市多个案件真相，郝运最终得知自己的真实身世，在办案过程中也和吴爱爱擦出了感情的火花，两人在一起了。
《动物管理局》故事设定在一个人类和动物转换者共同存在的特殊背景下，动物管理局的职责就是维护两个世界的和平共存，比较有意思的是，剧中有转化人的设定，也就是动物可以变成人类的模样，而在这样特定的故事背景下，一桩桩离奇案件背后的真相更引人入胜。
